国务院出台两岸融合发展意见书后福建积极响应，中央有关部门也积极配合，M503新航线就是在这个政策背景下推出的，是民航局配合福建遂行两岸融合发展的具体实践。
从军事上说，之前南北向的飞行雷达不容易判断军机与民航机，现在东西向飞行由于机场就是福州与厦门，台湾当局的雷达很容易识别，所以不存在什么军事风险。
另一方面，M503新航线其实就是福州厦门飞台湾的专用航线，福州厦门飞出的国际航班不可能走这条新航线，在春节前启用只有一个目的就是推动两岸融合发展惠及两岸同胞。
现在是台湾当局新旧政权交接的过渡期，大陆方面在此时经由M503新航线释出善意，在国际形势与台湾当局新政权新形势的局面下，台湾当局要冷静思考了，切不可有大陆踩压红线的看法。
